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項目介紹


宏基因組學(Metagenomics)研究通過全基因組鳥槍法(Whole  Genome Shotgun，WGS)測序策略，將提取獲得的微生物組總DNA隨機打斷為短片段，并構建合適長度的插入片段文庫，對這些文庫進行雙端(Paired-end，PE)高通量測序，從而能精細地展示整個菌群的功能代謝譜和物種精細組成譜，進而在組成和功能水平分別挖掘關鍵生物標記物，從原理上闡明微生物群落在生態系統中發揮作用的根本機制。

技術路線：

樣品要求

1.DNA：DNA濃度>20ng/ul，體積大于20ul；并確保DNA無降解，無污染；

2.環境樣本：土壤5-10 g，污泥/沉積物5-10 g，水體-濾膜過濾至有可見覆蓋物，糞便3-5 g，血液10 mL；

3.樣本處理時，需避免污染，保存期間切忌反復凍融，且需要干冰寄送的樣本，請提前自行準備干冰。

項目案例

基于GraPhlAn的樣本總體分類等級樹圖

種水平的優勢微生物關聯網絡圖

Top50差異物種的聚類熱圖

宏基因組

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